Franziska Günther studierte an der Humboldt-Universität zu Berlin Schulmusik, Chorleitung und Germanistik und an der Musikhochschule „Hanns Eisler“ in Berlin Gesang und Gesangspädagogik und schloss beide Studiengänge jeweils mit einem Diplom ab.
Ihre hauptberufliche Tätigkeit übt sie als Fachbereichsleiterin für Musik, Musiklehrerin (Leistungskurse, Zusatzkurse Musik u.a.) und seit 2001 als Chorleiterin der „Young Voices MDG“ am Max-Delbrück-Gymnasium Berlin-Niederschönhausen aus.
Von 1996 bis 2008 leitete sie den Kammerchor „enCHORe“, mit dem sie mehrfach erfolgreich an Wettbewerben teilnahm. 2009 gründete sie das ambitionierte a cappella Gesangsensemble „Fugatonale“.
Sie arbeitete als Dozentin für Stimmbildung beim Berliner Chorleiterseminar, als Gesangspädagogin an den Musikschulen Berlin-Treptow und Prenzlau sowie als Stimmbildnerin im Berliner Oratorien-Chor und im Uckermärkischen Konzertchor.
Zusätzlich ist sie als Sopransolistin in Berlin und Umgegend gefragt. Sie gestaltete Uraufführungen verschiedener Werke der Neuen Musik, ist in Kantoreien in Berlin und Umgebung gefragt und war bei Konzerten und CD-Aufnahmen des Ernst-Senff-Chores Berlin, des Kammerchores Brandenburg sowie des Eres-Ensembles engagiert.